Correction: Marginal Likelihood Estimate Comparisons to Obtain Optimal Species Delimitations in Silene sect. Cryptoneurae (Caryophyllaceae)

نویسندگان

  • Zeynep Aydin
  • Thomas Marcussen
  • Alaattin Selcuk Ertekin
  • Bengt Oxelman
چکیده

Coalescent-based inference of phylogenetic relationships among species takes into account gene tree incongruence due to incomplete lineage sorting, but for such methods to make sense species have to be correctly delimited. Because alternative assignments of individuals to species result in different parametric models, model selection methods can be applied to optimise model of species classification. In a Bayesian framework, Bayes factors (BF), based on marginal likelihood estimates, can be used to test a range of possible classifications for the group under study. Here, we explore BF and the Akaike Information Criterion (AIC) to discriminate between different species classifications in the flowering plant lineage Silene sect. Cryptoneurae (Caryophyllaceae). We estimated marginal likelihoods for different species classification models via the Path Sampling (PS), Stepping Stone sampling (SS), and Harmonic Mean Estimator (HME) methods implemented in BEAST. To select among alternative species classification models a posterior simulation-based analog of the AIC through Markov chain Monte Carlo analysis (AICM) was also performed. The results are compared to outcomes from the software BP&P. Our results agree with another recent study that marginal likelihood estimates from PS and SS methods are useful for comparing different species classifications, and strongly support the recognition of the newly described species S. ertekinii.

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

ثبت نام

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

A taxonomic study on the genus Silene (Caryophyllaceae) in Iran

The genus Silene includes 98 species in Iran, with 35 endemic to the Iranian plateau (26 species for Iran). The Iranian species are placed in 21 sections. In this article, the most important characteristics for the separation of the sections, relationships between the sections, and an identification key for the sections in Iran are presented. For each section a distribution map is provided. The...

متن کامل

مطالعه تشریحی تعدادی از گونه های Silene L. Sect. Auriculatae (Caryophyllaceae) در سطح جمعیت در ایران

Silene Sect. Auriculatae با 36 گونه شامل 22 گونه انحصاری مهم ترین بخش Silene در ایران است. پژوهش حاضر به منظور توصیف خصوصیات تشریحی ساقه و برگ و ارزیابی اهمیت تاکسونومیکی آن در گونه های انحصاری S. renzii، S. microphylla، S. parjumanensis، S. persica، S. rhynchocarpa، S. nizvana، S. gertraudiae و S. sojakii در سطح جمعیت در ایران انجام شد. 19 صفت کمی و کیفی ساقه و 25 صفت برگ از 5 اسلاید برای هر ج...

متن کامل

Silene capitellata و S. retinervis ((Caryophyllaceae گزارش‏های جدید برای ایران

طی کاوش‏های انجام شده در استان‏های قزوین و آذربایجان‌غربی، نمونه‌های جالبی از جنس Silene جمع‏آوری شدند. Silene capitellata از بخش Capitellatae که بیشتر در ترکیه پراکنش دارد، از کوه‏های منطقه الموت در استان قزوین جمع‏آوری شده است. همچنین S. retinervis از بخش Auriculatae  که توسط غضنفر از کوه قندیل عراق معرفی شده بود، از سه رویشگاه در پیرانشهر و زیوه از استان آذربایجان غربی جمع‏آوری شدند. این دو ...

متن کامل

The indumentum of vegetative and reproductive parts of annual Silene L. species (Caryophyllaceae) in Iran

Large and diverse genera, such as Silene need more reliable morphological traits for the credible identification and delimitation of the species. Despite the fact that the type of indumentum among the species of Silene had been addressed in most available revisions, monographs and floristic studies, the trichome-based features and their adaptational importance have not been investigated explici...

متن کامل

Notes on Silene chustupica, a new record and occurrence of S. dianthoides in Iran replacing with S. marcowiczii

The genus Silene, with more than 100 species in Iran is an important genus of Iranian flora. According to available data on the northwestern parts of Iran, including three provinces of Ardabil, East and West Azarbaijan are considered as a major diversity center of perennial species of the genus Silene in Iran. In the course of a revision of Silene in this area, some interesting specimens were c...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

ثبت نام

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

عنوان ژورنال:

دوره 9  شماره 

صفحات  -

تاریخ انتشار 2014